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解決方案

激光技術(shù)與基因測(cè)序:窺探生命的密碼

來(lái)源:神奇激光世界-長(zhǎng)春新產(chǎn)業(yè)2020-12-07 我要評(píng)論(0 )   

基因測(cè)序基因測(cè)序是一種新型基因檢測(cè)技術(shù),簡(jiǎn)單來(lái)說(shuō),就是將DNA/RNA分子中堿基ATGC的排列順序顯示出來(lái)?;驕y(cè)序技術(shù)能夠從血液或唾液中分析測(cè)定基因全序列,從而鎖定個(gè)...

基因測(cè)序

基因測(cè)序是一種新型基因檢測(cè)技術(shù),簡(jiǎn)單來(lái)說(shuō),就是將DNA/RNA分子中堿基ATGC的排列順序顯示出來(lái)?;驕y(cè)序技術(shù)能夠從血液或唾液中分析測(cè)定基因全序列,從而鎖定個(gè)人病變基因,提前預(yù)防和治療。

1977年,Walter Gilbert和Frederick Sanger建立了DNA測(cè)序技術(shù),并于1980年獲得諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)。由此開始,這項(xiàng)在未來(lái)主導(dǎo)生命科學(xué)領(lǐng)域發(fā)展的技術(shù)開始被廣泛應(yīng)用于研究工作中。

至今為止的四十多年時(shí)間內(nèi),基因測(cè)序進(jìn)行了多次技術(shù)變革。而激光熒光技術(shù)則在基因測(cè)序的發(fā)展中擔(dān)任了關(guān)鍵的角色。

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第一代基因測(cè)序技術(shù)(Sanger測(cè)序)是基于Sanger雙脫氧終止法的測(cè)序原理,結(jié)合熒光標(biāo)記和毛細(xì)管陣列電泳技術(shù)來(lái)實(shí)現(xiàn)測(cè)序的自動(dòng)化,基本方法是鏈終止或降解法。該方法隨后改用熒光核苷酸標(biāo)記、毛細(xì)管電泳區(qū)分和激光檢測(cè),從而實(shí)現(xiàn)了第一代自動(dòng)化測(cè)序法。

雖然第一代DNA測(cè)序技術(shù)測(cè)序讀長(zhǎng)可達(dá)1000bp,準(zhǔn)確性高達(dá)99.999%,但由于其高成本、低通量,所以影響了大規(guī)模的應(yīng)用。

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第二代基因測(cè)序技術(shù)(Next-generation sequencing,NGS)以舍棄讀長(zhǎng)為代價(jià) 實(shí)現(xiàn)了高通量測(cè)序 ,一次運(yùn)行即可同時(shí)得到幾十萬(wàn)到幾百萬(wàn)條核酸分子的序列。

第一代測(cè)序?yàn)楹铣山K止測(cè)序,而二代測(cè)序開創(chuàng)性的引入了可逆終止末端,從而實(shí)現(xiàn)邊合成邊測(cè)序。在DNA復(fù)制過(guò)程中通過(guò)激光激發(fā)熒光信號(hào),掃描捕捉新添加的堿基所攜帶的特殊標(biāo)記(一般為熒光分子標(biāo)記)來(lái)確定DNA的序列。

第二代基因測(cè)序憑借著高通量、低成本、測(cè)序時(shí)間短等優(yōu)勢(shì),很快在全球測(cè)序市場(chǎng)中占據(jù)了主導(dǎo)地位,其應(yīng)用領(lǐng)域包括無(wú)創(chuàng)產(chǎn)前檢測(cè)(NIPT)、胚胎植入前遺傳學(xué)診斷/篩查(PGD/PGS)、遺傳病診斷、腫瘤診斷和個(gè)性化治療、致病基因檢測(cè)、病原微生物檢測(cè)等。

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第三代DNA測(cè)序技術(shù)主要包括:Helico Bioscience單分子測(cè)序技術(shù)、Pacific Bioscience單分子實(shí)時(shí)(Single molecule realtime,SMRT)測(cè)序技術(shù)和Oxford Nanopore納米孔單分子測(cè)序技術(shù)(通過(guò)納米孔帶來(lái)的“電信號(hào)”變化實(shí)時(shí)測(cè)序)3種。

與前兩代測(cè)序技術(shù)相比,其最大的特點(diǎn)就是單分子測(cè)序,測(cè)序過(guò)程無(wú)需進(jìn)行PCR擴(kuò)增,并且理論上可以測(cè)定無(wú)限長(zhǎng)度的核酸序列。 因此第三代測(cè)序技術(shù)又稱為單分子DNA 測(cè)序,即通過(guò)現(xiàn)代光學(xué)、高分子、納米技術(shù)等手段來(lái)區(qū)分堿基信號(hào)差異的原理,以達(dá)到直接讀取序列信息的目的。 不需要使用生物或化學(xué)試劑,能夠進(jìn)一步降低成本。

而目前第三代測(cè)序最大的問(wèn)題是錯(cuò)誤率較高(15-40%)。 但出錯(cuò)是隨機(jī)的,并不會(huì)像第二代測(cè)序技術(shù)那樣存在測(cè)序錯(cuò)誤的偏向,因而可以通過(guò)多次測(cè)序來(lái)進(jìn)行有效的糾錯(cuò)。

對(duì)比三代基因測(cè)序,小編腦海里浮現(xiàn)了一個(gè)大膽的比喻

圖三可能只有北方朋友才能秒懂

激光器&基因測(cè)序

能否通過(guò)激光高效激發(fā)分別針對(duì)四種 DNA核苷酸(ACGT)化學(xué)標(biāo)記的熒光,能否精準(zhǔn)地區(qū)分四種熒光染料,這些對(duì)于基因測(cè)序來(lái)說(shuō)至關(guān)重要。 所以, 激光器的選擇會(huì)直接影響 測(cè)序的準(zhǔn)確性和 高效性。

1、激光波長(zhǎng):

目前基因測(cè)序市場(chǎng)常用波長(zhǎng):488 nm、514 nm、532 nm、577nm、639nm、660 nm、690nm......

長(zhǎng)春新產(chǎn)業(yè)—基因測(cè)序?qū)S眉す馄?/p>

2、激光功率:mW級(jí)到W級(jí)。

(1) 對(duì)于DNA單鏈被高度放大、空間上高度集中的應(yīng)用來(lái)說(shuō),熒光信號(hào)更強(qiáng),所需激光器功率更低;

(2)對(duì)于取樣點(diǎn)遍布需要大面積照明的大型流動(dòng)池或滑道中,就會(huì)需要較高功率;

(3)因?yàn)槎滩ㄩL(zhǎng)(如488nm)更容易對(duì)樣品造成功能性損傷,所以 會(huì)選擇較低功率。

3、穩(wěn)定性:

基因測(cè)序?qū)嶒?yàn)及應(yīng)用中,對(duì)激光器的可靠性以及長(zhǎng)期工作的功率穩(wěn)定性要求很高,如果激光器的功率偏差很大,會(huì)直接影響測(cè)試的整個(gè)數(shù)據(jù)集。

長(zhǎng)春新產(chǎn)業(yè)488nm—4小時(shí)功率穩(wěn)定性(均方根值)

4、可定制的解決方案

在公司或高校的研發(fā)及實(shí)驗(yàn)中,除了對(duì)激光器的光學(xué)參數(shù)要求外,更需要的是“定制化”的解決方案。簡(jiǎn)單一些的如光纖傳輸、光斑整形,復(fù)雜一些的如多波長(zhǎng)合成,多個(gè)波長(zhǎng)之間高一致性等等。

長(zhǎng)春新產(chǎn)業(yè)—多波長(zhǎng)激光器(可定制)

敲重點(diǎn)

長(zhǎng)春新產(chǎn)業(yè)的激光器具有高穩(wěn)定性、小體積、低功耗、風(fēng)冷/傳導(dǎo)散熱等特點(diǎn)。目前,長(zhǎng)春新產(chǎn)業(yè)用于基因測(cè)序的激光器已實(shí)現(xiàn)量產(chǎn),每年為測(cè)序儀制造商批量供貨。針對(duì)客戶實(shí)驗(yàn)/設(shè)備需求,我們可提供:

1、 特 殊波長(zhǎng)激光器: 如 550nm、561nm、 577nm、589nm、 607nm、639nm ......

2、多波長(zhǎng)激光系統(tǒng):

(1)光纖耦合輸出,整體功率可達(dá)8W以上,且支持功率微調(diào);

(2)長(zhǎng)時(shí)間工作的功率/波長(zhǎng)穩(wěn)定性好:100小時(shí)功率穩(wěn)定性<3%,100小時(shí)所有波長(zhǎng)穩(wěn)定性±0.1nm;

(3)光譜純度高;

(4)光束能量勻化,消散斑效果顯著;

(5)開關(guān)光時(shí)間極短,可達(dá)百納秒量級(jí),可獨(dú)立/同時(shí)開關(guān)光;

(6)支持RS232接口控制,滿足不同客戶整合要求。

3、定制的光學(xué)方案。

長(zhǎng)春新產(chǎn)業(yè)—定制化解決方案

除基因測(cè)序外,該系列激光器同時(shí)被廣泛應(yīng)用于PCR、流式細(xì)胞術(shù)、生物顯微成像等生物領(lǐng)域中。


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激光技術(shù)激光器
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